«МАНИФЕСТА-1» (1996) проводилась в 16 музеях и 36 общественных пространствах на территории Парка музеев в Роттердаме. Кураторами биеннале были Каталин Нерей (Будапешт), Роза Мартинес (Барселона), Виктор Мизиано (Москва), Эндрю Рентон (Лондон) и Ханс­-Ульрих Обрист (Лондон).

«МАНИФЕСТА-2» (1998) проходила на территории пяти музеев, творческих и общественных пространств  Люксембурга. Ее кураторами выступили Роберт Флек (Дюссельдорф), Мария Линд (Стокгольм) и Барбара Вандерлинден (Брюссель). Помимо выставки работ 47 художников, в рамках биеннале была организована программа художественного образования, в которой приняли участие 30 молодых авторов со всей Европы.

«МАНИФЕСТА-3» (2000) проводилась на трех главных художественных площадках Любляны и представляла работы художников, художественных коллективов, градостроителей и архитекторов. Ее кураторами были Франческо Бонами (Нью-­Йорк/Турин), Оле Боуман (Роттердам/Шеньчжэнь), Мария Хлавайова (Амстердам/Утрехт) и Катрин Ромберг (Берлин/Вена).

«МАНИФЕСТА-4» (2002) прошла во Франкфурте­-на-­Майне под кураторством Яры Бубновой (София), Нурии Энгиты Майо (Валенсия) и Стефании Муасдон Тремли (Париж). Проекты биеннале, проходившей в общественных городских пространствах, транслировались по телевидению, радио и интернету.
Кроме того, в 2002 году в рамках «МАНИФЕСТА» было положено начало постоянному мероприятию «Кофе-брейк», в рамках которого проводятся регулярные встречи со зрителями, что дает возможность для публичного обсуждения концепции развития биеннале.

В 2003 году было основано международное издание Manifesta Journal, посвященное теориям и практикам современного кураторства.

«МАНИФЕСТА-5» (2004) была проведена в Сан-­Себастьяне под кураторством Массимилиано Джони (Милан/Нью-Йорк) и Марты Кузьма (Венеция/Стокгольм). Эта биеннале была тесно связана с традициями самобытной баскской культуры. Тем самым «МАНИФЕСТА» сменила ориентир с традиционного для нее дискурса «Восток­-Запад» на не менее интересную дихотомию «Север-Юг».

Планировалось, что шестая биеннале «МАНИФЕСТА» в 2006 году будет организована в форме художественной школы в Никосии (Кипр). Отмена мероприятия стала доказательством того, насколько непростой может оказаться работа в условиях обостренной политической ситуации.

«МАНИФЕСТА-7»  (2008) проводилась в Тренто под кураторством Адама Будака (Вашингтон), Ансельма Франке (Берлин), Хилы Пелег (Берлин) и группы «Ракс Медиа» (Raqs Media Collective, Нью-Дели). Биеннале проходила не только в самом городе, но и по всему региону.

Городами, принимающими «МАНИФЕСТА-8» (2010) стали Мурсия и Картахена на юго-востоке Испании. Курировали биеннале три независимых коллектива: «Александрийский форум современных искусств» (Alexandria Contemporary Arts Forum, ACAF); «Палата общественных тайн» (Chamber of Public Secrets, CPS), члены которой проживают в Великобритании, Египте, Италии, Ливане и Дании; tranzit.org, группа независимых проектов из Австрии, Чехии, Венгрии, Словакии и Румынии. Место проведения биеннале вдохновило организаторов поднять тему диалога с Северной Африкой.

«МАНИФЕСТА-9» (2012) была проведена на территории бывшей шахты Ватершей в городе Генк (Бельгия). Ее кураторами стали Куаутемок Медина (Мехико), Катерина Грегос (Брюссель) и Дон Эйдс (Лондон). На этой биеннале наряду с работами современных художников была представлена выдающаяся коллекция произведений искусства прошлого. Еще одним аспектом биеннале стало исследование богатого наследия этого горнопромышленного региона.